El estudio del IISC identifica múltiples mutaciones y encuentra proteínas únicas en el genoma del SARS-CoV-2

El sudy descubrió que el cuerpo produce varias proteínas propias a medida que lanza una defensa inmunológica en respuesta al ataque viral.

El genoma del SARS-CoV-2 codifica más de 25 proteínas, pero hasta ahora solo se han identificado un puñado de estas proteínas Crédito de la imagen: fotograzia / Getty Images

Un estudio del Instituto Indio de Ciencia (IISc) ha identificado múltiples mutaciones y proteínas únicas en aislados de SARS-CoV-2, el virus que causa COVID-19. . El estudio reciente, publicado en el Journal of Proteome Research, también ha demostrado que el anfitrión produce varias proteínas propias cuando su cuerpo lanza una defensa inmunológica en respuesta al ataque viral, dijo el jueves IISc, con sede en Bengaluru, en un comunicado. Para comprender mejor cómo está mutando el virus y su biología proteica (las proteínas se fabrican a partir de información genética), un equipo del IISc dirigido por Utpal Tatu, profesor del Departamento de Bioquímica, ha llevado a cabo una investigación proteogénómica exhaustiva, una serie de análisis Aislados de SARS-CoV-2.
Los aislamientos o muestras virales se recuperaron de las secreciones nasales de COVID-19 consentido individuos positivos aquí.
El análisis genómico se realizó utilizando lo que los biólogos moleculares como Tatu denominan secuenciación de próxima generación (NGS), una tecnología que permite la secuenciación rápida de todo el genoma.
Él dice que la secuenciación de los genomas de las cepas virales de todo el mundo es importante porque ayuda a realizar un seguimiento de las mutaciones que surgen constantemente.
El análisis de su equipo sugiere que el virus ahora está mutando más rápido que antes, los tres aislados de Bengaluru tenían 27 mutaciones en sus genomas con más de 11 mutaciones por muestra, más que el promedio nacional (8.4) y el promedio global (7.3).
Para comprender la propagación y la historia evolutiva del virus, el equipo construyó un árbol filogenético global, o un árbol de parentesco, de aislamientos virales utilizando los datos de la secuencia.
El análisis filogenético encontró que los aislados de Bengaluru están más estrechamente relacionados con el de Bangladesh.
También mostró que los aislados en India tienen múltiples orígenes en lugar de haber evolucionado a partir de una única variante ancestral, según el comunicado.
El genoma del SARS-CoV-2 codifica más de 25 proteínas, pero hasta ahora solo se han identificado un puñado de estas proteínas, dijo.
"El estudio de las proteínas virales proporciona información funcional que actualmente no está bien representada", dice Tatu.
En el análisis proteómico, su equipo detectó 13 proteínas diferentes, la mayoría de ellas no identificadas previamente en muestras clínicas.
"Se había predicho una de esas proteínas llamada Orf9b, que suprime la respuesta inmune del huésped, pero el equipo de IISc proporcionó la primera evidencia de su expresión", dijo.
"El simple hecho de saber cómo funciona el virus no será suficiente. Necesitamos ponerlo en el contexto del anfitrión", dice Tatu.
Por lo tanto, en el tercer análisis, su equipo exploró cómo nuestros cuerpos responden al virus al examinar las proteínas del huésped.
Descubrieron hasta 441 proteínas exclusivas de los pacientes positivos a COVID-19, muchas de las cuales se especula que desempeñan un papel clave en la respuesta inmunitaria del cuerpo.
Los análisis proteómicos se llevaron a cabo mediante una técnica denominada espectrometría de masas de alta resolución.
El equipo se muestra optimista sobre el potencial que tiene este método para realizar pruebas a gran escala.
Las proteínas pueden ser marcadores confiables de infecciones como COVID-19 porque son más abundantes y estables en comparación con las moléculas de ARN de las que se basan las pruebas de RT-PCR predominantes.
Sheetal Tushir, estudiante de doctorado y primer autor del artículo, dice: "Lo mejor que podemos (esperar) ver en este siglo es el uso de la espectrometría de masas como técnica básica para el diagnóstico".

Via: FirstPost